Avustralyalı Girişimci, Köpeği İçin Yapay Zeka Destekli Deneysel Kanser Tedavisi Geliştirdi

Avustralyalı bilişim girişimcisi Paul Cunningham, makine öğrenimi konusundaki uzmanlığını, çok sayıda kötü huylu tümör teşhisi konulan köpeği Rosie'yi kurtarmak için kullandı. 2019 yılında barınaktan sahiplenilen Staffordshire Terrier ve Shar Pei kırması Rosie'ye, 2024 yılında köpeklerde en sık görülen cilt kanseri türü olan agresif bir mast hücreli tümör teşhisi konuldu. Cerrahi müdahale ve kemoterapi gibi standart tedavi yöntemleri hastalığın ilerlemesini sadece yavaşlatabildi ancak tümörlerde bir küçülme sağlamadı. Veteriner hekimler, Rosie için bir ila altı ay arasında bir ömür biçmişti.

Bu umutsuz tablo karşısında, Core Intelligence Technologies'in kurucu ortaklarından olan Cunningham, meseleyi bir veri işleme problemi olarak ele almaya karar verdi. Yaklaşık 3.000 dolara mal olan bir süreçle tümörün DNA dizilimini çıkartan girişimci, spesifik kanser mutasyonlarını belirlemek için bu verileri sağlıklı hücrelerin DNA'sı ile karşılaştırdı. Genetik verilerin analizi aşamasında yapay zeka araçlarından faydalanan Cunningham, ChatGPT'yi araştırma asistanı, Google DeepMind'ın AlphaFold sistemini ise modelleme için kullandı. ChatGPT, immünoterapi seçeneğini değerlendirmeyi de içeren bir eylem planı oluşturulmasına yardımcı oldu ve girişimciyi Yeni Güney Galler Üniversitesi (UNSW) bünyesindeki Ramaciotti Genomik Merkezi'ne yönlendirdi.

Proteinlerin üç boyutlu yapısını tahmin etmek için tasarlanan AlphaFold sistemi, anormal proteinlerin modellenmesinde kullanılarak gelecekteki aşı için hedef noktalar olan neoantijenlerin kesin olarak belirlenmesini sağladı. Yapay zeka tarafından derlenen ve bir mRNA dizisinden oluşan bu bilgiler, Profesör Pall Thordarson liderliğindeki UNSW RNA Enstitüsü'ndeki bilim insanlarına iletildi. Uzmanlar, elde edilen verileri, COVID-19 aşılarında kullanılan teknolojiye benzer bir yöntemle fiziksel bir mRNA yapısına dönüştürdü.

Hesaplamalı biyoloji alanında doçent ve UNSW RNA Enstitüsü Direktörü olan Profesör Martin Smith, bu vakanın kişiselleştirilmiş mRNA aşılarının geliştirme döngüsünün ne kadar hızlı ve nispeten düşük maliyetli tamamlanabileceğini kanıtladığını belirtti. Deneysel veteriner immünoterapisi için gerekli etik onayların alınmasının ardından, kişiselleştirilmiş ilacın ilk enjeksiyonu 2025 yılının Noel döneminde Rosie'ye uygulandı. Tedavinin başlamasından sadece bir ay sonra çarpıcı sonuçlar elde edildi: Tümörlerden biri yarı yarıya küçülürken, bir diğeri %75 oranında azaldı. Rosie'nin genel sağlık durumu iyileşti ve enerji seviyesinde belirgin bir artış gözlendi.

Bilim insanları, bu başarının geniş çaplı bir klinik araştırma değil, münferit bir vaka olduğunun ve yaygın kullanım için yıllara ihtiyaç duyulduğunun altını çiziyor. Rosie'nin tümörlerinden birinin ilk doza yanıt vermemesi üzerine Cunningham ve ekibi, nedenleri belirlemek ve tedavinin bir sonraki aşamasını geliştirmek için ikinci bir dizileme turu başlattı. Bununla birlikte, biyoloji eğitimi olmayan bir uzmanın yapay zeka yardımıyla bir fikri çalışan bir tedaviye dönüştürebilmesi, benzer yaklaşımların insanlardaki onkolojik hastalıkların tedavisinde de kullanılması adına yeni bir perspektif sunuyor.