Вчені представили CellWalker2, обчислювальний інструмент з відкритим кодом, розроблений для вдосконалення класифікації типів клітин та порівняння в різних дослідженнях. Опублікований у Cell Genomics 22 травня 2025 року, цей інструмент використовує ієрархічні зв'язки між типами клітин для надання більш точних анотацій.
CellWalker2 інтегрує одно-клітинний ATAC-seq (аналіз для транспозазо-доступного хроматину за допомогою секвенування) з даними секвенування РНК, розширюючи свої можливості до мульти-оміксних профілів. Ця інтеграція полегшує з'єднання регуляторних елементів ДНК з активними генами, пропонуючи глибше розуміння клітинних функцій. Інструмент відображає регуляторні ділянки ДНК, активні в певних типах клітин, і ідентифікує фактори транскрипції, які організовують зміни експресії генів.
Пояснюючи зв'язки між типами клітин і генами, які ними керують, CellWalker2 дозволяє вченим зіставляти типи клітин у різних експериментах, навіть тих, що проводяться в різних лабораторіях або між видами. CellWalker2 є вільно доступним онлайн для інших дослідників, сприяючи широкому впровадженню та співпраці в біомедичній спільноті.