CycleHCR: Нова техніка візуалізації революціонізує відображення РНК і білків у товстих біологічних зразках

Дослідники з Janelia Research Campus Медичного інституту Говарда Хьюза розробили cycleHCR, нову техніку візуалізації, яка значно покращує відображення молекул РНК і білків у товстих біологічних зразках. Цей метод вирішує проблеми традиційних технік, яким було важко візуалізувати численні молекули в товстих тканинах. CycleHCR використовує систему ДНК-штрихкодів для маркування та відстеження сотень молекул РНК і білків в окремих клітинах, забезпечуючи повне уявлення про їх організацію в тканинах. У цьому методі використовується ланцюгова реакція гібридизації (HCR) з кількома флуорофорами для покращення видимості. На відміну від попередніх методів, обмежених кількістю доступних флуоресцентних кольорів, ДНК-штрихкоди cycleHCR дозволяють маркувати кожну конкретну молекулу, що дозволяє проводити кілька циклів візуалізації на одному й тому ж зразку. Це дозволяє виявляти сотні або тисячі РНК в одному зразку. Цей метод також поширюється на виявлення білків, пропонуючи повний набір інструментів для аналізу розподілу РНК і білків. Автоматизовані процеси вимірювання збільшили пропускну здатність, дозволяючи виявляти до дюжини молекулярних видів за один день. Дослідники вивчають потенціал cycleHCR для клінічного використання в діагностичній візуалізації, особливо для захворювань, де інформативні моделі експресії генів. Liu Lab надає відкритий доступ до послідовностей штрихкодів, щоб сприяти ширшому впровадженню cycleHCR.