Генетичний аналіз зразків калу покращує діагностику кишкових захворювань, пропонуючи кращі заходи реагування в галузі громадського здоров'я та розуміння інфекцій.
Дослідження Ліверпульського університету зробило значний крок у розумінні та діагностиці інфекційних кишкових захворювань. У дослідженні було проаналізовано понад 1000 зразків калу за допомогою метагеномного (на основі ДНК) та метатранскриптомного (на основі РНК) секвенування. Ці передові методи ідентифікують генетичний матеріал безпосередньо зі зразків пацієнтів, на відміну від традиційних методів, які вимагають вирощування організмів у лабораторії.
Дослідження виявило інфекції, пропущені стандартними тестами, і надало інформацію про те, як бактерії поводяться в кишечнику. Зокрема, дослідження зафіксувало всебічний знімок експресії генів Salmonella зі зразка людського калу. Ці транскриптомні дані пропонують нове розуміння того, як бактерії виживають після виходу з людського кишечника, що є цінним для націлювання на цей патоген.
Основні висновки підкреслюють ефективність РНК-тестів у виявленні прихованих інфекцій, включаючи паразитів і РНК-віруси. РНК залишалася стабільною у зразках калу без консервантів, що свідчить про її надійність. Співвідношення РНК до ДНК допомогло відрізнити справжні інфекції від нешкідливих кишкових мікробів, забезпечуючи чіткіше уявлення про процес інфекції.
За словами професора Алістера Дарбі, ці генетичні інструменти можуть революціонізувати ідентифікацію та розуміння кишкових інфекцій. Завдяки розумінню не лише того, що є присутнім, але й того, що воно робить, можна покращити заходи реагування в галузі громадського здоров'я. Це дослідження демонструє потенціал для інновацій в охороні здоров'я та пропонує дані з відкритим доступом для допомоги іншим дослідникам і агентствам громадського здоров'я.
Доктор Едвард Каннінгем-Окс додав, що результати показують, що РНК може надати інформацію про те, як працюють інфекції. Це відкриває нові можливості для більш ефективної діагностики та лікування цих захворювань. Висновки можуть значно вплинути на те, як діагностуються та лікуються діарейні захворювання, особливо зі зростаючою потребою в швидкій та точній діагностиці.