Новый алгоритм машинного обучения под названием PAMmla значительно повышает точность и настраиваемость редактирования генов CRISPR-Cas9 [1]. Разработанный исследователями из Mass General Brigham, PAMmla анализирует миллионы вариантов фермента CRISPR-Cas9 для прогнозирования их специфичности и активности [1, 4]. Это достижение устраняет серьезное ограничение современных систем Cas9: риск побочных эффектов, когда фермент разрезает непреднамеренные участки генома [1].
PAMmla может предсказывать функциональность более 64 миллионов вариантов ферментов, что позволяет разрабатывать персонализированные ферменты для конкретных генетических мутаций [1, 4]. Это позволяет исследователям создавать более целенаправленные и эффективные версии фермента Cas9 [1]. Алгоритм сочетает в себе высокопроизводительную инженерию белков с машинным обучением для достижения такого уровня точности [1, 4].
Разработка PAMmla представляет собой значительный шаг вперед в создании более безопасных и эффективных методов генной терапии для различных генетических заболеваний [1, 4]. Минимизируя побочные эффекты и повышая эффективность редактирования, PAMmla предлагает более масштабируемое и точное решение для редактирования генома [4, 7]. Алгоритм теперь доступен для широкого научного сообщества, что позволяет исследователям применять этот метод для решения своих задач по редактированию генов [1].