Исследователи из Института рака Дана-Фарбер разработали новый инструмент геномного скрининга Perturb-multiome для обратного инжиниринга генетического программирования в клетках. Этот инновационный инструмент использует технологию CRISPR для изучения того, как факторы транскрипции влияют на рост и развитие клеток, что потенциально может революционизировать лечение заболеваний крови.
Perturb-multiome позволяет ученым одновременно отключать несколько факторов транскрипции в различных типах клеток крови, что позволяет проводить всесторонний анализ взаимодействий между генами. Команда провела анализ отдельных клеток для отслеживания изменений в экспрессии генов и доступности ДНК, выявляя регуляторные сети, которые управляют дифференцировкой и функцией клеток. По данным Института рака Дана-Фарбер, варианты в областях доступного хроматина, чувствительных к факторам транскрипции, хотя и составляют менее 0,3% генома, демонстрируют примерно 100-кратное обогащение наследуемости по определенным фенотипам клеток крови.
Исследование было сосредоточено на незрелых клетках крови, выявляя области ДНК, которые существенно влияют на развитие клеток крови. Многие из этих областей содержат мутации, связанные с гематологическими расстройствами. Это открытие может привести к новым методам генной терапии таких заболеваний, как серповидно-клеточная анемия и бета-талассемия. FDA уже одобрило некоторые методы генной терапии серповидно-клеточной анемии на основе CRISPR.
Совместное исследование, в котором участвовали эксперты из Dana-Farber и Бостонского детского центра рака и заболеваний крови, подчеркивает важность междисциплинарных подходов к решению сложных биологических вопросов. Исследование финансировалось такими организациями, как La Caixa Foundation, Rafael del Pino Foundation и American Society of Hematology.