Революционный метод под названием MATQ-seq позволяет ученым углубиться в сложный мир отдельных бактериальных клеток. Эта передовая технология предоставляет профили экспрессии генов с высоким разрешением, предлагая беспрецедентное понимание того, как бактерии реагируют на различные стимулы, включая стресс и антибиотики.
MATQ-seq работает путем захвата мРНК, которая выявляет конкретные гены, активные внутри каждой клетки. В отличие от предыдущих методов, MATQ-seq сохраняет примерно 95% клеток, обеспечивая более точный и всесторонний анализ поведения бактерий. Эта улучшенная скорость удержания позволяет исследователям изучать даже небольшие бактериальные популяции в нишах хозяина или внутриклеточные бактерии.
Метод может обнаруживать от 300 до 600 генов на клетку, предоставляя глубокое понимание бактериальных состояний, таких как метаболизм и вирулентность. Понимая эти состояния, ученые могут разрабатывать более эффективные и целенаправленные методы лечения инфекций. Усовершенствованный протокол MATQ-seq включает автоматизацию, более эффективную обратную транскриптазу и удаление рРНК на основе Cas9, что приводит к снижению потери клеток и улучшению захвата транскриптов. Этот прогресс обещает новую эру в микробиологии, позволяя проводить профилирование активности генов с высоким разрешением в сложных микробных сообществах.