CycleHCR: Eine neue Bildgebungstechnik revolutioniert die Visualisierung von RNA und Proteinen in dicken biologischen Proben

Forscher am Janelia Research Campus des Howard Hughes Medical Institute haben CycleHCR entwickelt, eine neuartige Bildgebungstechnik, die die Visualisierung von RNA- und Proteinmolekülen in dicken biologischen Proben deutlich verbessert. Diese Methode behebt die Einschränkungen traditioneller Techniken, die Schwierigkeiten hatten, zahlreiche Moleküle in dicken Geweben abzubilden. CycleHCR verwendet ein DNA-Barcode-System, um Hunderte von RNA- und Proteinmolekülen in einzelnen Zellen zu markieren und zu verfolgen, wodurch ein umfassender Überblick über deren Organisation innerhalb von Geweben ermöglicht wird. Die Technik verwendet eine Hybridisierungs-Kettenreaktion (HCR) mit mehreren Fluorophoren, um die Sichtbarkeit zu verbessern. Im Gegensatz zu früheren Methoden, die durch die Anzahl der verfügbaren Fluoreszenzfarben begrenzt waren, ermöglichen die DNA-Barcodes von CycleHCR die Markierung jedes einzelnen Moleküls, wodurch mehrere Bildgebungsrunden an derselben Probe durchgeführt werden können. Dies ermöglicht den Nachweis von Hunderten oder Tausenden von RNAs in einer einzigen Probe. Die Technik erstreckt sich auch auf den Proteinnachweis und bietet ein umfassendes Toolkit zur Analyse von RNA- und Proteinverteilungen. Automatisierte Messprozesse haben den Durchsatz erhöht und ermöglichen den Nachweis von bis zu einem Dutzend molekularer Spezies an einem einzigen Tag. Forscher untersuchen das Potenzial von CycleHCR für den klinischen Einsatz in der diagnostischen Bildgebung, insbesondere bei Krankheiten, bei denen Genexpressionsmuster informativ sind. Das Liu Lab bietet offenen Zugang zu Barcode-Sequenzen, um eine breitere Akzeptanz von CycleHCR zu fördern.