CellWalker2:開源工具助力2025年細胞類型分類和多體學數據整合

编辑者: Elena HealthEnergy

科學家們推出了一款名為CellWalker2的開源計算工具,旨在改進細胞類型分類和跨不同研究的比較。該工具於2025年5月22日發表在Cell Genomics上,它利用細胞類型之間的層級關係,提供更精確的註釋。

CellWalker2集成了單細胞ATAC-seq(轉座酶可及染色質測序)與RNA測序數據,從而擴展了其多體學分析能力。這種整合有助於將調控DNA元件與活躍基因聯繫起來,從而更深入地了解細胞功能。該工具可以繪製在特定細胞類型中活躍的調控DNA區域,並識別協調基因表達變化的轉錄因子。

通過闡明細胞類型之間的關係以及控制它們的基因,CellWalker2使科學家能夠匹配不同實驗中的細胞類型,即使這些實驗是在不同的實驗室或跨物種進行的。CellWalker2可在線上免費訪問,以促進生物醫學界的廣泛採用和合作。

來源

  • Scienmag: Latest Science and Health News

  • Gladstone Institutes

  • GitHub

  • EurekAlert!

  • Google Cloud Vertex AI Search

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