Дослідники з Інституту раку Дана-Фарбер розробили новий інструмент геномного скринінгу Perturb-multiome для реверсивного проектування генетичного програмування в клітинах. Цей інноваційний інструмент використовує технологію CRISPR для вивчення того, як фактори транскрипції впливають на ріст і розвиток клітин, що потенційно може революціонізувати лікування захворювань крові.
Perturb-multiome дозволяє вченим одночасно вимикати кілька факторів транскрипції в різних типах клітин крові, що дозволяє проводити комплексний аналіз взаємодій ген-ген. Команда провела аналізи окремих клітин, щоб відстежувати зміни в експресії генів і доступності ДНК, виявляючи регуляторні мережі, які керують диференціацією та функцією клітин. За даними Інституту раку Дана-Фарбер, варіанти в межах чутливих до факторів транскрипції доступних регіонів хроматину, хоча й становлять менше 0,3% геному, демонструють приблизно 100-кратне збагачення спадковості в певних фенотипах клітин крові.
Дослідження було зосереджено на незрілих клітинах крові, ідентифікуючи ділянки ДНК, які значно впливають на розвиток клітин крові. Багато з цих ділянок містять мутації, пов'язані з гематологічними розладами. Це відкриття може призвести до нових генних терапій для таких захворювань, як серповидноклітинна анемія та бета-таласемія. FDA вже схвалило деякі генні терапії на основі CRISPR для серповидноклітинної анемії.
Спільне дослідження, в якому взяли участь експерти з Дана-Фарбер і Бостонського дитячого центру раку та захворювань крові, підкреслює важливість міждисциплінарних підходів у вирішенні складних біологічних питань. Дослідження фінансувалися такими організаціями, як La Caixa Foundation, Rafael del Pino Foundation і American Society of Hematology.