Дослідження мутацій SARS-CoV-2 виявило помилки обробки даних у генетичних базах даних

Дослідження Інституту інтегративної системної біології (CSIC) та Університету Валенсії виявило помилки в обробці даних у базі даних GISAID, широко використовуваному ресурсі для генетичної інформації про SARS-CoV-2. Дослідження, опубліковане в *Virus Evolution*, досліджувало здатність вірусу мутувати та інфікувати людей, зосереджуючись на подіях відновлення делецій у спайковому білку, який вірус використовує для проникнення в клітини. Команда виявила, що початкові висновки, які свідчили про часті події відновлення делецій — коли вірус, здається, виправляє свій геном — значною мірою були зумовлені помилками в тому, як оброблялися вірусні послідовності. Ці помилки створили хибне враження, що вірус відновлює мутації регулярніше, ніж насправді. Порівнюючи інформацію з бази даних із необробленими даними секвенування геному, дослідники отримали більш точне розуміння генетичних змін вірусу. Мірея Косколла Девіс, дослідниця CSIC і керівник дослідження, зазначила, що частота цих подій відновлення делецій була значно переоцінена через невідповідності в обробці даних у різних лабораторіях. Дослідження підтвердило, що хоча деякі події відновлення є справжніми, більшість були артефактами обробки послідовностей. Менше 60% початково зареєстрованих подій відновлення делецій вдалося підтвердити, причому скоригована частота, за оцінками, була в 5-51 разів нижчою, ніж було зазначено спочатку. Незважаючи на їхню рідкість, ці події відновлення можуть тонко впливати на поведінку вірусу, потенційно впливаючи на те, як він проникає в клітини або взаємодіє з антитілами, виробленими вакцинацією. Дослідження підкреслює критичну важливість ретельного вивчення генетичних даних, щоб уникнути неточних висновків про вірусну еволюцію. Вчені також наголошують на необхідності централізованої системи обміну геномними даними патогенів в Іспанії для покращення моніторингу та реагування на інфекційні захворювання.