Cientistas apresentaram o CellWalker2, uma ferramenta computacional de código aberto projetada para refinar a classificação e comparação de tipos celulares em diversos estudos. Publicada na Cell Genomics em 22 de maio de 2025, esta ferramenta aproveita as relações hierárquicas entre os tipos celulares para fornecer anotações mais precisas.
O CellWalker2 integra o ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) de célula única com dados de sequenciamento de RNA, expandindo suas capacidades para perfis multi-ômicos. Essa integração facilita a conexão de elementos de DNA regulatórios a genes ativos, oferecendo insights mais profundos sobre as funções celulares. A ferramenta mapeia regiões de DNA regulatórias ativas em tipos celulares específicos e identifica fatores de transcrição que orquestram as mudanças na expressão gênica.
Ao elucidar as relações entre os tipos celulares e os genes que os governam, o CellWalker2 permite que os cientistas correspondam aos tipos celulares entre diferentes experimentos, mesmo aqueles conduzidos em diferentes laboratórios ou entre espécies. O CellWalker2 é livremente acessível online para outros pesquisadores, promovendo ampla adoção e colaboração dentro da comunidade biomédica.