CycleHCR: Nowa technika obrazowania rewolucjonizuje wizualizację RNA i białek w grubych próbkach biologicznych

Naukowcy z Janelia Research Campus w Howard Hughes Medical Institute opracowali CycleHCR, nową technikę obrazowania, która znacznie poprawia wizualizację cząsteczek RNA i białek w grubych próbkach biologicznych. Metoda ta rozwiązuje ograniczenia tradycyjnych technik, które miały trudności z obrazowaniem licznych cząsteczek w grubych tkankach. CycleHCR wykorzystuje system kodów kreskowych DNA do oznaczania i śledzenia setek cząsteczek RNA i białek w pojedynczych komórkach, zapewniając kompleksowy widok ich organizacji w tkankach. Technika ta wykorzystuje reakcję łańcuchową hybrydyzacji (HCR) z wieloma fluoroforami w celu zwiększenia widoczności. W przeciwieństwie do poprzednich metod, które były ograniczone liczbą dostępnych kolorów fluorescencyjnych, kody kreskowe DNA CycleHCR umożliwiają oznaczanie każdej konkretnej cząsteczki, umożliwiając przeprowadzenie wielu rund obrazowania na tej samej próbce. Umożliwia to wykrycie setek lub tysięcy RNA w pojedynczej próbce. Technika ta rozciąga się również na wykrywanie białek, oferując kompleksowy zestaw narzędzi do analizy dystrybucji RNA i białek. Zautomatyzowane procesy pomiarowe zwiększyły przepustowość, umożliwiając wykrycie do kilkunastu gatunków molekularnych w ciągu jednego dnia. Naukowcy badają potencjał CycleHCR do zastosowań klinicznych w diagnostyce obrazowej, szczególnie w przypadku chorób, w których informacyjne są wzorce ekspresji genów. Liu Lab zapewnia otwarty dostęp do sekwencji kodów kreskowych, aby ułatwić szersze przyjęcie CycleHCR.