CycleHCR: Nieuwe beeldvormingstechniek revolutioneert visualisatie van RNA en eiwitten in dikke biologische monsters

Onderzoekers van de Janelia Research Campus van het Howard Hughes Medical Institute hebben cycleHCR ontwikkeld, een nieuwe beeldvormingstechniek die de visualisatie van RNA- en eiwitmoleculen in dikke biologische monsters aanzienlijk verbetert. Deze methode pakt de beperkingen aan van traditionele technieken, die moeite hadden met het afbeelden van talrijke moleculen in dikke weefsels. CycleHCR gebruikt een DNA-barcodesysteem om honderden RNA- en eiwitmoleculen in individuele cellen te labelen en te volgen, waardoor een uitgebreid overzicht ontstaat van hun organisatie binnen weefsels. De techniek maakt gebruik van hybridisatiekettingreactie (HCR) met meerdere fluorforen om de zichtbaarheid te vergroten. In tegenstelling tot eerdere methoden die werden beperkt door het aantal beschikbare fluorescerende kleuren, maken de DNA-barcodes van cycleHCR het mogelijk om elk specifiek molecuul te labelen, waardoor meerdere beeldvormingsrondes op hetzelfde monster kunnen worden uitgevoerd. Hierdoor kunnen honderden of duizenden RNA's in één monster worden gedetecteerd. De techniek strekt zich ook uit tot eiwitdetectie en biedt een uitgebreide toolkit voor het analyseren van RNA- en eiwitdistributies. Geautomatiseerde meetprocessen hebben de doorvoer verhoogd, waardoor tot een dozijn moleculaire soorten op één dag kunnen worden gedetecteerd. Onderzoekers onderzoeken het potentieel van cycleHCR voor klinisch gebruik in diagnostische beeldvorming, met name voor ziekten waarbij genexpressiepatronen informatief zijn. Het Liu Lab biedt open toegang tot barcodesequenties om een bredere acceptatie van cycleHCR te bevorderen.