Genetische analyse van ontlastingsmonsters verbetert de diagnose van darmziekten, wat leidt tot betere volksgezondheidsreacties en een beter begrip van infecties.
Een studie van de Universiteit van Liverpool heeft een belangrijke vooruitgang geboekt in het begrijpen en diagnosticeren van infectieuze darmziekten. Het onderzoek analyseerde meer dan 1.000 ontlastingsmonsters met behulp van metagenomische (DNA-gebaseerde) en metatranscriptomische (RNA-gebaseerde) sequencing. Deze geavanceerde technieken identificeren genetisch materiaal rechtstreeks uit patiëntmonsters, in tegenstelling tot traditionele methoden waarbij organismen in een laboratorium moeten worden gekweekt.
De studie onthulde infecties die door standaardtests werden gemist en gaf inzicht in hoe bacteriën zich in de darm gedragen. In het bijzonder legde het onderzoek een uitgebreide momentopname vast van de genexpressie van Salmonella uit een menselijk ontlastingsmonster. Deze transcriptomische gegevens bieden een nieuw begrip van hoe de bacteriën overleven nadat ze de menselijke darm hebben verlaten, wat waardevol is voor het richten op dit pathogeen.
Belangrijkste bevindingen benadrukken de effectiviteit van RNA-tests bij het opsporen van verborgen infecties, waaronder parasieten en RNA-virussen. Het RNA bleef stabiel in ontlastingsmonsters zonder conserveermiddelen, wat wijst op de robuustheid ervan. De verhouding tussen RNA en DNA hielp bij het onderscheiden van echte infecties van onschadelijke darmmicroben, waardoor een duidelijker beeld van het infectieproces ontstond.
Volgens professor Alistair Darby kunnen deze genetische hulpmiddelen een revolutie teweegbrengen in de identificatie en het begrip van darm infecties. Door niet alleen te begrijpen wat er aanwezig is, maar ook wat het doet, kunnen de reacties op de volksgezondheid worden verbeterd. Deze studie demonstreert het potentieel voor innovatie in de gezondheidszorg en biedt open-access data om andere onderzoekers en volksgezondheidsinstanties te helpen.
Dr. Edward Cunningham-Oakes voegde eraan toe dat de resultaten aantonen dat RNA inzicht kan geven in hoe infecties werken. Dit opent nieuwe mogelijkheden voor het effectiever diagnosticeren en behandelen van deze ziekten. De bevindingen kunnen een aanzienlijke impact hebben op de manier waarop diarreeziekten worden gediagnosticeerd en behandeld, vooral met de groeiende behoefte aan snelle, nauwkeurige diagnostiek.