AIが遺伝子伝達による細菌の抗生物質耐性拡散を予測

広範な遺伝子データで訓練されたAIモデルが、細菌における抗生物質耐性の発達を予測できるようになった。チャルマース工科大学の研究によると、抗生物質耐性は、遺伝的に類似した細菌間で、特に廃水処理施設や人体内でより容易に伝達されるという。 チャルマース工科大学およびヨーテボリ大学の教授であるエリック・クリスティアンソンは、「ヒトに有害な細菌は、多くの耐性遺伝子を蓄積しています...私たちの研究は、これらの遺伝子が病原性細菌にどのように伝達されるかを学ぶために、この複雑な進化プロセスを調べています。これにより、将来の細菌がどのように耐性を発達させるかを予測することが可能になります」と述べている。 *Nature Communications*で詳述されているAIモデルは、細菌のDNA、構造、生息地のデータを使用して、過去の遺伝子伝達を分析した。このモデルは、約100万個の細菌ゲノムで訓練された。 チャルマースおよびヨーテボリ大学の博士課程の学生であるデビッド・ルンドは、「ヒトや水処理施設で見つかった細菌は、遺伝子伝達によって耐性になる可能性が高いことがわかります...耐性遺伝子が細菌から別の細菌に「ジャンプ」する可能性を高めるもう1つの重要な要因は、細菌の遺伝的類似性です」と指摘している。 モデルの精度は、既知の耐性遺伝子伝達に対してテストされた。5つのケースのうち4つで、モデルは伝達を正確に予測した。研究者たちは、診断とモニタリングでの使用のためにモデルを改良し、多剤耐性菌の検出を改善し、抗生物質が存在する環境をモニタリングすることを期待している。