SARS-CoV-2変異の研究で、遺伝子データベースにおけるデータ処理エラーが明らかに

統合システム生物学研究所（CSIC）とバレンシア大学による研究で、SARS-CoV-2の遺伝情報に関する広く利用されているリソースであるGISAIDデータベースにおけるデータ処理エラーが明らかになりました。*Virus Evolution*に掲載されたこの研究では、ウイルスが細胞に侵入するために使用するスパイクタンパク質の欠失修復イベントに焦点を当て、ウイルスの変異およびヒトへの感染能力を調査しました。 研究チームは、ウイルスがゲノムを修正するように見える頻繁な欠失修復イベントを示唆する初期の発見は、主にウイルス配列の処理方法のエラーによるものであることを発見しました。これらのエラーは、ウイルスが実際よりも頻繁に変異を修復しているという誤った印象を与えました。研究者らは、データベース情報を生のゲノム配列決定データと比較することで、ウイルスの遺伝的変化についてより正確な理解を得ました。 CSICの研究者であり、研究リーダーであるミレイア・コスコラ・デビスは、これらの欠失修復イベントの頻度は、異なる研究室間でのデータ処理の不整合により、大幅に過大評価されていると指摘しました。この研究では、一部の修復イベントは本物であるものの、大部分は配列処理のアーティファクトであることが確認されました。最初に報告された欠失修復イベントの60％未満しか検証できず、修正された頻度は、当初示されたよりも5〜51倍低いと推定されました。 これらの修復イベントはまれですが、ウイルスの挙動に微妙な影響を与え、細胞への侵入方法やワクチン接種によって生成された抗体との相互作用に影響を与える可能性があります。この研究は、ウイルスの進化について不正確な結論を導き出さないように、遺伝子データを注意深く精査することの重要性を強調しています。科学者たちはまた、感染症の監視と対応を改善するために、スペインにおける病原体ゲノムデータを共有するための中央集権的なシステムの必要性を強調しています。