जून 2025 में, येकातेरिनबर्ग में विवादास्पद गिरफ्तारियों के बाद रूस और अज़रबैजान के बीच राजनयिक संबंध तेजी से बिगड़ गए। रूसी विशेष सेवाओं ने अज़रबैजानी मूल के लगभग 50 व्यक्तियों को हिरासत में लिया, उन पर 2001-2011 के बीच हत्याओं और हमलों में शामिल होने का संदेह था। गिरफ्तारियों के दौरान दो लोगों की मौत हो गई, जिससे बाकू में आक्रोश फैल गया।
जवाब में, अज़रबैजान ने रूस के साथ सभी नियोजित सांस्कृतिक कार्यक्रम रद्द कर दिए और बाकू में रूसी मीडिया एजेंसी स्पुतनिक के कार्यालय की समीक्षा की। क्रेमलिन ने संयम से प्रतिक्रिया व्यक्त की, राष्ट्रपति के प्रवक्ता दिमित्री पेसकोव ने बाकू के फैसले पर खेद व्यक्त करते हुए जोर दिया कि येकातेरिनबर्ग की स्थिति के कारण ऐसी प्रतिक्रिया नहीं होनी चाहिए थी। रूसी विदेश मंत्रालय ने कहा कि हालांकि हताहत और हिरासत में लिए गए लोग जातीय अज़रबैजानी थे, लेकिन उनके पास रूसी पासपोर्ट थे।
यह राजनयिक संकट 2024 के अंत में अज़रबैजानी विमान दुर्घटना के बाद से दोनों देशों के बीच संबंधों के लिए एक और परीक्षा है। अज़रबैजान ब्रिक्स सदस्यता के लिए आवेदन करने सहित अपनी अंतर्राष्ट्रीय स्थिति को मजबूत करने की भी कोशिश कर रहा है। अज़रबैजान पश्चिम के साथ सहयोग और मास्को के साथ रणनीतिक संबंध बनाए रखने के बीच संतुलन बनाने की कोशिश कर रहा है। इस स्थिति में, भारत की विदेश नीति की तरह, अज़रबैजान भी विभिन्न शक्तियों के साथ अपने संबंधों को संतुलित करने का प्रयास कर रहा है।