CycleHCR : Une nouvelle technique d'imagerie révolutionne la visualisation de l'ARN et des protéines dans des échantillons biologiques épais

Des chercheurs du Janelia Research Campus de l'Institut médical Howard Hughes ont développé cycleHCR, une nouvelle technique d'imagerie qui améliore considérablement la visualisation des molécules d'ARN et de protéines dans des échantillons biologiques épais. Cette méthode répond aux limites des techniques traditionnelles, qui avaient du mal à imager de nombreuses molécules dans des tissus épais. CycleHCR utilise un système de codes-barres ADN pour marquer et suivre des centaines de molécules d'ARN et de protéines dans des cellules individuelles, offrant une vue complète de leur organisation dans les tissus. La technique utilise une réaction en chaîne d'hybridation (HCR) avec plusieurs fluorophores pour améliorer la visibilité. Contrairement aux méthodes précédentes limitées par le nombre de couleurs fluorescentes disponibles, les codes-barres ADN de cycleHCR permettent de marquer chaque molécule spécifique, ce qui permet d'effectuer plusieurs cycles d'imagerie sur le même échantillon. Cela permet de détecter des centaines, voire des milliers, d'ARN dans un seul échantillon. La technique s'étend également à la détection des protéines, offrant une boîte à outils complète pour l'analyse des distributions d'ARN et de protéines. Les processus de mesure automatisés ont augmenté le débit, permettant la détection de jusqu'à une douzaine d'espèces moléculaires en une seule journée. Les chercheurs étudient le potentiel de cycleHCR pour une utilisation clinique dans l'imagerie diagnostique, en particulier pour les maladies où les profils d'expression génique sont informatifs. Le Liu Lab donne un accès libre aux séquences de codes-barres afin de faciliter une adoption plus large de cycleHCR.