Científicos han presentado CellWalker2, una herramienta computacional de código abierto diseñada para refinar la clasificación y comparación de tipos celulares en diversos estudios. Publicada en Cell Genomics el 22 de mayo de 2025, esta herramienta aprovecha las relaciones jerárquicas entre los tipos celulares para ofrecer anotaciones más precisas.
CellWalker2 integra el ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) de células individuales con datos de secuenciación de ARN, ampliando sus capacidades a perfiles multi-ómicos. Esta integración facilita la conexión de elementos de ADN reguladores con genes activos, ofreciendo una visión más profunda de las funciones celulares. La herramienta mapea las regiones de ADN reguladoras activas en tipos celulares específicos e identifica los factores de transcripción que orquestan los cambios en la expresión génica.
Al dilucidar las relaciones entre los tipos celulares y los genes que los gobiernan, CellWalker2 permite a los científicos hacer coincidir los tipos celulares entre diferentes experimentos, incluso aquellos realizados en diferentes laboratorios o entre especies. CellWalker2 es de acceso libre en línea para otros investigadores, promoviendo una amplia adopción y colaboración dentro de la comunidad biomédica.