一項值得關注的進展是，科學家們越來越多地觀察到長鬚鯨和藍鯨雜交產生的雜交鯨魚。2025年4月在聖勞倫斯河口最近的目擊事件突顯了這一現象，強調了海洋生物多樣性的複雜性，並提出了重要的保護問題。
這些雜交種，有時被稱為“長鬚藍鯨”，表現出雙親物種的身體特徵，使得視覺識別具有挑戰性。遺傳分析證實，這些雜交種並不總是像以前認為的那樣不育。這種被稱為基因滲入的雜交現象，似乎從長鬚鯨到藍鯨更為常見，這引發了人們對瀕危藍鯨種群遺傳完整性的擔憂。
專家認為，氣候變化和種群數量下降等環境壓力可能導致雜交現象的增加。目前的保護工作重點是監測這一趨勢，並保護這兩個物種的棲息地，以確保這些海洋巨獸的長期健康和復原力。這些雜交種的繁殖能力也引發了人們對藍鯨長期遺傳獨特性的擔憂，尤其是在它們面臨棲息地變化和其他環境壓力的情況下。