CellWalker2:开源工具助力2025年细胞类型分类和多组学数据整合

编辑者: Elena HealthEnergy

科学家们推出了一款名为CellWalker2的开源计算工具,旨在改进细胞类型分类和跨不同研究的比较。该工具于2025年5月22日发表在Cell Genomics上,它利用细胞类型之间的层级关系,提供更精确的注释。

CellWalker2集成了单细胞ATAC-seq(转座酶可及染色质测序)与RNA测序数据,从而扩展了其多组学分析能力。这种整合有助于将调控DNA元件与活跃基因联系起来,从而更深入地了解细胞功能。该工具可以绘制在特定细胞类型中活跃的调控DNA区域,并识别协调基因表达变化的转录因子。

通过阐明细胞类型之间的关系以及控制它们的基因,CellWalker2使科学家能够匹配不同实验中的细胞类型,即使这些实验是在不同的实验室或跨物种进行的。CellWalker2可在线免费访问,以促进生物医学界的广泛采用和合作。

来源

  • Scienmag: Latest Science and Health News

  • Gladstone Institutes

  • GitHub

  • EurekAlert!

  • Google Cloud Vertex AI Search

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