YZ, Bakterilerde Gen Transferi Yoluyla Antibiyotik Direncinin Yayılmasını Tahmin Ediyor

Kapsamlı genetik veriler üzerinde eğitilmiş bir YZ modeli, artık bakterilerde antibiyotik direnci gelişimini tahmin edebiliyor. Chalmers Teknoloji Üniversitesi'nden bir çalışma, antibiyotik direncinin genetik olarak benzer bakteriler arasında, özellikle atık su arıtma tesislerinde ve insan vücudunda daha kolay aktarıldığını gösteriyor. Chalmers Teknoloji Üniversitesi ve Gothenburg Üniversitesi'nde Profesör olan Erik Kristiansson, "İnsanlar için zararlı olan bakteriler, birçok direnç geni biriktirmiştir... Araştırmamız, bu genlerin patojenik bakterilere nasıl aktarıldığını öğrenmek için bu karmaşık evrimsel süreci inceliyor. Bu, gelecekteki bakterilerin nasıl direnç geliştireceğini tahmin etmeyi mümkün kılıyor." diyor. *Nature Communications*'da detaylandırılan YZ modeli, bakteriyel DNA, yapı ve yaşam alanı verilerini kullanarak geçmiş gen transferlerini analiz etti. Model, yaklaşık bir milyon bakteri genomu üzerinde eğitildi. Chalmers ve Gothenburg Üniversitesi'nde doktora öğrencisi olan David Lund, "İnsanlarda ve su arıtma tesislerinde bulunan bakterilerin, gen transferi yoluyla dirençli hale gelme olasılığının daha yüksek olduğunu görüyoruz... Direnç genlerinin bir bakteriden diğerine 'atlama' olasılığını artıran bir diğer önemli faktör ise bakterilerin genetik benzerliğidir." diye belirtiyor. Modelin doğruluğu, bilinen direnç geni transferlerine karşı test edildi. Beş vakadan dördünde model, transferi doğru bir şekilde tahmin etti. Araştırmacılar, modeli teşhis ve izlemede kullanılmak üzere iyileştirmeyi, potansiyel olarak çoklu dirençli bakterilerin tespitini iyileştirmeyi ve antibiyotiklerin bulunduğu ortamları izlemeyi umuyorlar.