Исследование мутаций SARS-CoV-2 выявило ошибки обработки данных в генетических базах данных

Исследование, проведенное Институтом интегративной системной биологии (CSIC) и Университетом Валенсии, выявило ошибки обработки данных в базе данных GISAID, широко используемом ресурсе для генетической информации о SARS-CoV-2. Исследование, опубликованное в *Virus Evolution*, было посвящено изучению способности вируса мутировать и заражать людей, с акцентом на события восстановления делеций в спайк-белке, который вирус использует для проникновения в клетки. Команда обнаружила, что первоначальные результаты, указывающие на частые события восстановления делеций — когда вирус, по-видимому, исправляет свой геном — во многом были связаны с ошибками в обработке вирусных последовательностей. Эти ошибки создали ложное впечатление, что вирус восстанавливает мутации чаще, чем это происходит на самом деле. Сравнивая информацию из базы данных с необработанными данными секвенирования генома, исследователи получили более точное представление о генетических изменениях вируса. Мирея Косколла Девис, исследователь CSIC и руководитель исследования, отметила, что частота этих событий восстановления делеций была значительно переоценена из-за несоответствий в обработке данных в разных лабораториях. Исследование подтвердило, что, хотя некоторые события восстановления являются подлинными, большинство из них были артефактами обработки последовательностей. Менее 60% первоначально зарегистрированных событий восстановления делеций удалось подтвердить, при этом скорректированная частота, по оценкам, в 5–51 раз ниже, чем было указано первоначально. Несмотря на свою редкость, эти события восстановления могут тонко влиять на поведение вируса, потенциально влияя на то, как он проникает в клетки или взаимодействует с антителами, вырабатываемыми при вакцинации. Исследование подчеркивает критическую важность тщательного изучения генетических данных, чтобы избежать неточных выводов об эволюции вируса. Ученые также подчеркивают необходимость централизованной системы обмена геномными данными патогенов в Испании для улучшения мониторинга и реагирования на инфекционные заболевания.