Acinetobacter radioresistens, вид бактерий, обитающий в криптах толстой кишки - маленьком углублении в слизистой оболочке толстой кишки, секретирует индолуксусную кислоту (IAA) - метаболит (вещество, расщепляющее пищу, лекарства или химические вещества, а также собственные ткани), который ингибирует пролиферацию клеток, способствует гомеостазу кишечных стволовых клеток (ISC) и подавляет инициацию опухоли и колоректальный рак.
Исследователи *изучили влияние криптовой микробиоты на функцию ISC, используя бактериальные внешние мембранные везикулы. Полученные из Acinetobacter radioresistens, они подавляли пролиферацию клеток в органоидах, в отличие от визикул из Acinetobacter modestus и Delftia tsuruhatensis. Мутантный штамм A. radioresistens, лишенный способности производить IAA, не ингибировал пролиферацию клеток, что подтверждает роль защитную роль метаболита. Было обнаружено, что A. radioresistens сильно обогащен в криптах толстой кишки диких летучих мышей по сравнению с лабораторными мышами и здоровыми тканями пациентов с колоректальным раком человека.
Визикулы, полученные из A. radioresistens, ингибировали пролиферацию клеток в человеческих колоноидах IAA-зависимым образом. IAA, полученный из A. radioresistens, действует непосредственно на кишечные стволовые клетки, снижая экспрессию мишеней сигнализации Wnt-β-катенина [путь, участвующий в росте и развитии клеток]. A. radioresistens защищает от инициации опухоли у мышей IAA-зависимым образом.
Специфическое истощение A. radioresistens с использованием литического бактериофага (Ar-φ) увеличивало экспрессию β-катенина [белок, участвующий в клеточной сигнализации] и усиливало пролиферацию толстой кишки. Внесение Ar-φ способствовало туморогенезу (образованию рака) в модели колоректального рака, вызванной воспалением.
Защитный эффект A. radioresistens включает арил-углеводородный рецептор (ArR) - белка, который регулирует экспрессию генов в ответ на наличие определенных соединения в среде. Эти результаты показывают, что A. radioresistens защищает своего хозяина от инициации опухоли кишечника, ингибируя сигнализацию Wnt-β-катенина и уровень EphB2 (рецепторной тирозинкиназы) в криптах.
* Zhang, S., Peng, L., Goswami, S. et al. Intestinal crypt microbiota modulates intestinal stem cell turnover and tumorigenesis via indole acetic acid. Nat Microbiol (2025).