Analiza genetyczna próbek kału usprawnia diagnozowanie chorób jelit, oferując lepsze reakcje w zakresie zdrowia publicznego i zrozumienie infekcji.
Badanie przeprowadzone przez Uniwersytet w Liverpoolu stanowi znaczący postęp w zrozumieniu i diagnozowaniu zakaźnych chorób jelit. W ramach badania przeanalizowano ponad 1000 próbek kału przy użyciu sekwencjonowania metagenomicznego (opartego na DNA) i metatranskryptomicznego (opartego na RNA). Te zaawansowane techniki identyfikują materiał genetyczny bezpośrednio z próbek pacjentów, w przeciwieństwie do tradycyjnych metod, które wymagają hodowli organizmów w laboratorium.
Badanie ujawniło infekcje pominięte przez standardowe testy i dostarczyło wglądu w to, jak bakterie zachowują się w jelitach. W szczególności badanie uchwyciło kompleksowy obraz ekspresji genów Salmonella z próbki ludzkiego kału. Te dane transkryptomiczne oferują nowe zrozumienie tego, jak bakterie przeżywają po opuszczeniu ludzkiego jelita, co jest cenne w celowaniu w ten patogen.
Kluczowe odkrycia podkreślają skuteczność testów RNA w wykrywaniu ukrytych infekcji, w tym pasożytów i wirusów RNA. RNA pozostało stabilne w próbkach kału bez konserwantów, co wskazuje na jego trwałość. Stosunek RNA do DNA pomógł odróżnić prawdziwe infekcje od nieszkodliwych drobnoustrojów jelitowych, zapewniając jaśniejszy obraz procesu infekcji.
Według profesora Alistaira Darby, te narzędzia genetyczne mogą zrewolucjonizować identyfikację i zrozumienie infekcji jelitowych. Dzięki zrozumieniu nie tylko tego, co jest obecne, ale także tego, co robi, można poprawić reakcje w zakresie zdrowia publicznego. To badanie demonstruje potencjał innowacji w opiece zdrowotnej i oferuje dane o otwartym dostępie, aby pomóc innym badaczom i agencjom zdrowia publicznego.
Dr Edward Cunningham-Oakes dodał, że wyniki pokazują, że RNA może dostarczyć wglądu w to, jak działają infekcje. Otwiera to nowe możliwości skuteczniejszego diagnozowania i leczenia tych chorób. Odkrycia mogą znacząco wpłynąć na sposób diagnozowania i leczenia chorób biegunkowych, zwłaszcza przy rosnącym zapotrzebowaniu na szybką i dokładną diagnostykę.