Para ilmuwan telah memperkenalkan CellWalker2, sebuah alat komputasi sumber terbuka yang dirancang untuk menyempurnakan klasifikasi dan perbandingan tipe sel di berbagai penelitian. Diterbitkan di Cell Genomics pada 22 Mei 2025, alat ini memanfaatkan hubungan hierarkis antara tipe sel untuk memberikan anotasi yang lebih tepat.
CellWalker2 mengintegrasikan ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) sel tunggal dengan data sekuensing RNA, memperluas kemampuannya ke profil multi-omik. Integrasi ini memfasilitasi hubungan elemen DNA pengatur dengan gen aktif, menawarkan wawasan lebih dalam tentang fungsi seluler. Alat ini memetakan wilayah DNA pengatur yang aktif dalam tipe sel tertentu dan mengidentifikasi faktor transkripsi yang mengatur perubahan ekspresi gen.
Dengan menjelaskan hubungan antara tipe sel dan gen yang mengaturnya, CellWalker2 memungkinkan para ilmuwan untuk mencocokkan tipe sel di berbagai eksperimen, bahkan yang dilakukan di laboratorium yang berbeda atau di antara spesies. CellWalker2 dapat diakses secara bebas secara online oleh peneliti lain, mempromosikan adopsi luas dan kolaborasi dalam komunitas biomedis.