Durchbruch in der Proteinengineering mit KI: Ein Sprung in die evolutionäre Gestaltung

Bearbeitet von: Kateryna Carson

In einem bahnbrechenden Fortschritt an der Schnittstelle von künstlicher Intelligenz und Molekularbiologie hat ein Team unter der Leitung von Thomas Hayes ein neuartiges fluoreszierendes Protein unter Verwendung des multimodalen generativen Sprachmodells ESM3 entwickelt. Diese Innovation simuliert evolutionäre Prozesse, die sich über 500 Millionen Jahre erstrecken, und bietet tiefgreifende Einblicke in biologische Systeme sowie potenzielle Anwendungen neu gestalteter Proteine in der Medizin, Bioengineering und Umweltwissenschaft.

ESM3 unterscheidet sich von herkömmlichen Modellen, indem es über die Sequenzen, Strukturen und Funktionen von Proteinen nachdenkt, was eine detaillierte Erforschung der Eigenschaften von Proteinen durch ausgeklügelte diskrete Tokens ermöglicht. Dieser Ansatz ermöglicht es Wissenschaftlern, maßgeschneiderte Proteinfunktionen zu schaffen, die möglicherweise die synthetische Biologie und Biopharmazeutika revolutionieren.

Die Schulung des Modells umfasste ein beeindruckendes Datenset von 771 Milliarden einzigartigen Tokens, die aus 3,15 Milliarden unterschiedlichen Proteinsequenzen stammen. Diese umfangreiche Grundlage ermöglicht es ESM3, ohne Präzedenzfälle Proteinsequenzen zu generieren, die das aktuelle Verständnis der Proteinevolution in Frage stellen.

Mit einer skalierbaren Architektur, die über 98 Milliarden Parameter verfügt, erkennt ESM3 komplexe biologische Beziehungen und simuliert Millionen von Jahren evolutionärer Anpassung, um Proteine mit einzigartigen Eigenschaften zu generieren. Das neu synthetisierte fluoreszierende Protein zeigt bemerkenswerte Helligkeit und deutet auf Vorteile in fluoreszenzbasierten Anwendungen wie Bildgebung und Diagnostik hin.

In einem bedeutenden Schritt zur Zugänglichkeit wird ESM3 eine öffentliche Beta-Phase über eine API einführen, die es Forschern weltweit ermöglicht, seine fortschrittlichen Modellierungsfähigkeiten zu nutzen. Diese Demokratisierung fördert die kollaborative Forschung und ermöglicht es Wissenschaftlern, Proteine mit benutzerfreundlichen Werkzeugen zu entwickeln.

Die EvolutionaryScale Forge API bietet einen speziellen kostenlosen Zugang für akademische Zwecke und fördert Innovationen im Bereich der Proteinengineering. Der offene Code und die Gewichte des Modells dienen als wertvolle Ressourcen für computergestützte Biologen und gewährleisten eine robuste fortlaufende Forschung.

Während wir in eine neue Ära der synthetischen Biologie eintreten, veranschaulichen die Beiträge von ESM3, wie KI traditionelle Forschungsmethoden transformieren kann, und haben Auswirkungen auf Bereiche von der Gesundheitsversorgung bis hin zu Umweltwissenschaften. Die wissenschaftliche Gemeinschaft wird ermutigt, diese Technologie zu nutzen, um reale Herausforderungen zu bewältigen, mit dem Potenzial für grenzenlose Entdeckungen in der Biochemie.

Die Schaffung eines neuen fluoreszierenden Proteins durch ESM3 bedeutet einen Wandel in der Nutzung von KI zur Manipulation der Komplexität der Proteobiologie. Diese Forschung verkörpert die Verschmelzung von Technologie und Biochemie und läutet die Ära der KI-gesteuerten Biologie und ihrer vielversprechenden zukünftigen Entwicklungen ein.

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