Nghiên cứu đột biến SARS-CoV-2 tiết lộ lỗi xử lý dữ liệu trong cơ sở dữ liệu di truyền

Một nghiên cứu của Viện Sinh học Hệ thống Tích hợp (CSIC) và Đại học Valencia đã tiết lộ các lỗi xử lý dữ liệu trong cơ sở dữ liệu GISAID, một nguồn tài nguyên được sử dụng rộng rãi cho thông tin di truyền SARS-CoV-2. Nghiên cứu, được công bố trên *Virus Evolution*, đã điều tra khả năng đột biến và lây nhiễm sang người của vi rút, tập trung vào các sự kiện sửa chữa xóa trong protein gai, mà vi rút sử dụng để xâm nhập vào tế bào. Nhóm nghiên cứu phát hiện ra rằng những phát hiện ban đầu cho thấy các sự kiện sửa chữa xóa thường xuyên - nơi vi rút dường như đang sửa chữa bộ gen của nó - phần lớn là do lỗi trong cách xử lý các chuỗi vi rút. Những lỗi này đã tạo ra ấn tượng sai lầm rằng vi rút đang sửa chữa các đột biến thường xuyên hơn thực tế. Bằng cách so sánh thông tin cơ sở dữ liệu với dữ liệu giải trình tự bộ gen thô, các nhà nghiên cứu đã có được sự hiểu biết chính xác hơn về những thay đổi di truyền của vi rút. Mireia Coscollá Devís, một nhà nghiên cứu CSIC và là trưởng nhóm nghiên cứu, lưu ý rằng tần suất của các sự kiện sửa chữa xóa này đã bị đánh giá quá cao đáng kể do sự không nhất quán trong quá trình xử lý dữ liệu giữa các phòng thí nghiệm khác nhau. Nghiên cứu xác nhận rằng mặc dù một số sự kiện sửa chữa là có thật, nhưng phần lớn là do quá trình xử lý chuỗi. Ít hơn 60% số sự kiện sửa chữa xóa được báo cáo ban đầu có thể được xác thực, với tần suất đã được điều chỉnh ước tính thấp hơn 5 đến 51 lần so với chỉ định ban đầu. Mặc dù hiếm gặp, nhưng những sự kiện sửa chữa này có thể ảnh hưởng một cách tinh vi đến hành vi của vi rút, có khả năng ảnh hưởng đến cách nó xâm nhập vào tế bào hoặc tương tác với các kháng thể do tiêm chủng tạo ra. Nghiên cứu nhấn mạnh tầm quan trọng quan trọng của việc xem xét cẩn thận dữ liệu di truyền để tránh đưa ra kết luận không chính xác về sự tiến hóa của vi rút. Các nhà khoa học cũng nhấn mạnh sự cần thiết của một hệ thống tập trung để chia sẻ dữ liệu bộ gen mầm bệnh ở Tây Ban Nha để cải thiện việc theo dõi và ứng phó với các bệnh truyền nhiễm.