Trong một diễn biến đáng chú ý, các nhà khoa học ngày càng quan sát thấy các loài cá voi lai do sự giao phối giữa cá voi vây và cá voi xanh. Hiện tượng này, được nhấn mạnh bởi các vụ nhìn thấy gần đây ở cửa sông St. Lawrence vào tháng 4 năm 2025, nhấn mạnh sự phức tạp của đa dạng sinh học biển và đặt ra các câu hỏi quan trọng về bảo tồn.
Những loài lai này, đôi khi được gọi là "cá voi flue", thể hiện các đặc điểm thể chất của cả hai loài bố mẹ, gây khó khăn cho việc nhận dạng bằng mắt thường. Phân tích di truyền đã xác nhận rằng những loài lai này không phải lúc nào cũng vô sinh như người ta vẫn tin trước đây. Sự giao phối, được gọi là xâm nhập gen, dường như phổ biến hơn từ cá voi vây sang cá voi xanh, dẫn đến lo ngại về tính toàn vẹn di truyền của quần thể cá voi xanh đang bị đe dọa.
Các chuyên gia cho rằng các yếu tố gây căng thẳng từ môi trường, chẳng hạn như biến đổi khí hậu và suy giảm quần thể, có thể góp phần làm tăng sự lai tạo. Các nỗ lực bảo tồn hiện đang tập trung vào việc theo dõi xu hướng này và bảo vệ môi trường sống của cả hai loài để đảm bảo sức khỏe và khả năng phục hồi lâu dài của những gã khổng lồ đại dương này. Khả năng sinh sản của những loài lai này cũng làm dấy lên lo ngại về sự khác biệt di truyền lâu dài của cá voi xanh, đặc biệt khi chúng phải đối mặt với những thay đổi về môi trường sống và các áp lực môi trường khác.