SARS-CoV-2 Mutasyon Çalışması Genetik Veritabanlarında Veri İşleme Hatalarını Ortaya Çıkardı

Sistem Biyolojisi Enstitüsü (CSIC) ve Valencia Üniversitesi tarafından yapılan bir çalışma, SARS-CoV-2 genetik bilgisi için yaygın olarak kullanılan bir kaynak olan GISAID veritabanında veri işleme hatalarını ortaya çıkardı. *Virus Evolution* dergisinde yayınlanan araştırma, virüsün hücrelere girmek için kullandığı spike proteinindeki delesyon onarım olaylarına odaklanarak virüsün mutasyona uğrama ve insanlara bulaşma yeteneğini inceledi. Ekip, virüsün genomunu düzelttiği görünen sık delesyon onarım olaylarını öne süren ilk bulguların, büyük ölçüde viral dizilerin işlenme biçimindeki hatalardan kaynaklandığını keşfetti. Bu hatalar, virüsün mutasyonları gerçekte olduğundan daha düzenli olarak onardığı gibi yanlış bir izlenim yarattı. Araştırmacılar, veritabanı bilgilerini ham genom dizileme verileriyle karşılaştırarak virüsün genetik değişiklikleri hakkında daha doğru bir anlayış elde ettiler. CSIC araştırmacısı ve çalışma lideri Mireia Coscollá Devís, farklı laboratuvarlardaki veri işlemedeki tutarsızlıklar nedeniyle bu delesyon onarım olaylarının sıklığının önemli ölçüde abartıldığını belirtti. Çalışma, bazı onarım olayları gerçek olsa da, çoğunun dizi işlemenin artefaktları olduğunu doğruladı. Başlangıçta bildirilen delesyon onarım olaylarının %60'ından azı doğrulanabildi ve düzeltilmiş sıklığın başlangıçta belirtilenden 5 ila 51 kat daha düşük olduğu tahmin edildi. Bu onarım olayları nadir olmalarına rağmen, virüsün davranışını ince bir şekilde etkileyebilir ve potansiyel olarak hücrelere nasıl girdiği veya aşılama ile üretilen antikorlarla nasıl etkileşime girdiği üzerinde etkili olabilir. Çalışma, viral evrim hakkında yanlış sonuçlar çıkarmamak için genetik verileri dikkatlice incelemenin kritik önemini vurgulamaktadır. Bilim adamları ayrıca, bulaşıcı hastalıklara yönelik izleme ve müdahaleyi iyileştirmek için İspanya'da patojen genomik verilerini paylaşmak için merkezi bir sisteme duyulan ihtiyacın altını çiziyor.