Acinetobacter radioresistens, une espèce de bactérie vivant dans les cryptes du côlon - une petite dépression dans la muqueuse du côlon - sécrète de l'acide indolacétique (IAA) - un métabolite (une substance qui décompose les aliments, les médicaments ou les produits chimiques, ainsi que leurs propres tissus) qui inhibe la prolifération cellulaire, favorise l'homéostasie des cellules souches intestinales (ISC) et supprime l'initiation tumorale et le cancer colorectal.
Les chercheurs *ont étudié l'effet du microbiote cryptographique sur la fonction ISC en utilisant des vésicules membranaires externes bactériennes. Dérivés de Acinetobacter radioresistens, ils ont supprimé la prolifération cellulaire dans les organoïdes, contrairement aux visicules d'Acinetobacter modestus et de Delftia tsuruhatensis. La souche mutante de A. radioresistens, dépourvue de la capacité de produire de l'IAA, n'a pas inhibé la prolifération cellulaire, ce qui confirme le rôle protecteur du métabolite. Il a été constaté que A. radioresistens est fortement enrichi dans les cryptes du côlon des chauves-souris sauvages par rapport aux souris de laboratoire et aux tissus sains des patients atteints de cancer colorectal humain.
Les visicules dérivées de A. radioresistens ont inhibé la prolifération cellulaire dans les colonoïdes humains de manière dépendante de l'IAA. L'IAA Dérivé de A. radioresistens agit directement sur les cellules souches intestinales en réduisant l'expression des cibles de signalisation Wnt-β-caténine [voie impliquée dans la croissance et le développement des cellules]. A. radioresistens protège contre l'initiation de la tumeur chez la souris de manière dépendante de l'IAA. L'appauvrissement spécifique de A. radioresistens à l'aide d'un bactériophage lytique (Ar-φ) a augmenté l'expression de la β-caténine [protéine impliquée dans la signalisation cellulaire] et augmenté la prolifération du côlon. L'introduction d'Ar-φ a contribué à la tumorogenèse (formation de cancer) dans un modèle de cancer colorectal induit par l'inflammation.
L'effet protecteur de A. radioresistens implique le récepteur aryle-hydrocarbure (ArR), une protéine qui régule l'expression des gènes en réponse à la présence de certains composés dans le milieu. Ces résultats indiquent que A. radioresistens protège son hôte de l'initiation de la tumeur intestinale en inhibant la signalisation Wnt-β-caténine et le niveau d'EphB2 (récepteur tyrosine kinase) dans les cryptes.
* Zhang, S., Peng, L., Goswami, S. et al. Intestinal crypt microbiota modulates intestinal stem cell turnover and tumorigenesis via indole acetic acid. Nat Microbiol (2025).